Việc lập hóa đơn riêng tạo thuận lợi trong việc phân loại, quản lý những hóa đơn của những hàng hóa, dịch vụ được giảm thuế nhưng lại làm tăng thời gian của kế toán doanh nghiệp (DN); làm tăng chi phí sử dụng hóa đơn, nhất là các DN sử dụng nhiều hóa đơn trong ngày. Trước bất cập đó, hiện nay Bộ Tài chính đang đề xuất sửa đổi khoản 4 Điều 1 Nghị định 15/2022/NĐ-CP.